О светочувствительных каналах у одноклеточных эукариот и о том, как гигантские вирусы украли родопсины у своих хозяев

Этот Биосеминар организован совместно с семинаром кафедры збп. Ждём Вас! И напоминаем, что идеи докладчиков всегда с радостью будут приняты на bioseminars@mail.ru

1 марта, вторник,  17:30

онлайн в Zoom*

Андрей Розенберг, PhD

Факультет Биологии, Технион — Израильский технологический институт, Хайфа, Израиль

Как и у животных, у многих микробов есть родопсины — мембранные светочувствительные белки с ретиналем в качестве хромофора. Микробные родопсины за свою долгую эволюционную историю дали начало белкам с широким спектром активностей. Самые распространенные в природе родопсины — ионные насосы — используются многими прокариотами для получения энергии путем создания градиента ионов. В отличие от них, микробные родопсиновые рецепторы наделяют своих обладателей способностью к восприятию света, используя при этом механизмы, отличные от неродственных им животных родопсинов. Каналродопсины одноклеточных водорослей делают это путем модуляции мембранного потенциала — открываясь при поглощении фотонов света и деполяризуя или гиперполяризуя клеточную мембрану. Эти свойства делают каналродопсины и другие микробные родопсины удобными инструментами для изучения и контроля индивидуальных клеток многоклеточных организмов in situ, откуда происходит пристальный интерес к этим белкам.

Мы же поговорим о функциональной (мета)геномике, распространении каналродопсинов с разными активностями у одноклеточных эукариот и даже гигантских вирусов, их связи со “зрением”, а также о конвергентно возникших на принципиально иной основе родопсиновых каналах, формирующих гигантские мультимерные комплексы — их непростой эволюции и немного об их уникальных биофизических свойствах.

*Доклад — в Zoom, для получения ссылки заполните, пожалуйста, форму: https://forms.gle/7xik6tJsYVEun8UM7

Будем благодарны за помощь в распространении информации (сделайте, пожалуйста, репосты Вконтакте; перешлите этот e-mail коллегам). Большое спасибо!

Эволюция генов на примере ядов пчёл и змей: косные модели и пластичная природа

Этот Биосеминар организован совместно с семинаром кафедры збп. Ждём Вас! И напоминаем, что идеи докладчиков всегда с радостью будут приняты на bioseminars@mail.ru

19 октября, вторник,  17:30

онлайн в Zoom* и очно в 140 (3058 ) аудитории

Иван Колударов, PhD

Университет Юстуса Либиха и Мюнхенский Технический Университет, Германия

Иван – выпускник бакалавриата биофака СПбГУ 2008 года; в 2010 закончил магистратуру биофака СПбГУ и ФТИ имени Иоффе. В 2017 получил степень PhD Квинслендского Университета (Австралия), диссертация по эволюции ядов ящериц. Работал пост-доком в Окинавском Институте Науки и Технологии (Япония) и в Университете Юстуса Либиха в Гиссене (Германия). С сентября 2021 – получатель стипендии Александра фон Гумбольта для применения машинного обучения к изучению эволюции ядов. Иван специализируется на сравнительном геномном анализе эволюции генов; автор/со-автор нескольких десятков статьей по ядам различных животных и их эволюции.

За последние несколько десятилетий количество геномных данных выросло таким образом, что большую их часть видели только компьютеры. И хотя многие современные исследования используют это богатство непросеянной информации, то, что известно, несоизмеримо меньше того, что можно узнать. Генетика по-прежнему цепляется за примитивные модели эволюции генов, которые не подвергались пересмотру больше полувека. В этом семинаре мы поговорим про эволюцию биологических функций, как лучше всего использовать современные данные для её изучения и что это всё может значить для биологии 21го века.

*Доклад — в Zoom, для получения ссылки заполните, пожалуйста, форму: https://forms.gle/7xik6tJsYVEun8UM7
Слушать трансляцию доклада, задавать вопросы и получать ответы, обсуждать услышанное очно можно будет в 140 (3058 ) аудитории. Также трансляция планируется в YouTube и/или Вконтакте: информацию об этом проверяйте в обновлениях к этому посту накануне мероприятия. 

Будем благодарны за помощь в распространении информации (сделайте, пожалуйста, репосты Вконтакте; перешлите этот e-mail коллегам). Большое спасибо!

Трансляция лекции состоится в Главном здании СПбГУ (Университетская наб., д. 7/9; вход с Менделеевской линии; 2 этаж). При входе необходимо предъявить паспорт или другой документ. Посещение свободное, предварительная запись не требуется. В аудитории следует разместиться, соблюдая дистанцию.

Биосеминары: прямо сейчас

Итак, события развиваются стремительно: в честь Недели биологии на этой неделе — блок из трёх Биосеминаров под эгидой Студенческого научного общества биофака СПбГУ. Один предлагаем вам смотреть в записи (на странице СНО вконтакте: https://vk.com/sno_bio_spbu), а два других — приходите слушать в прямом эфире!

20 сентября (понедельник) — запись: https://vk.com/sno_bio_spbu

Юрий Барбитов, и. о. директора по науке Институт биоинформатики

«Высохшая» биология — как живые организмы превращаются в строки, и как с ними работать

В последние годы большинство публикаций по биологии в журналах Nature или Science так или иначе связаны с различными «омиками». Геномика, транскриптомика, протеомика — во всех этих областях большую роль играет биоинформатический анализ данных. В этой лекции мы поговорим о том, что такое биоинформатика и какие задачи можно решать с помощью вычислительных методов в современной биологии. Поговорим также о перспективных направлениях развития биоинформатики и о том, где можно получить полезные знания и навыки в этой сфере.

21 сентября (вторник), 18:00 онлайн (ссылка ниже)

Полина Дроздова, к.б.н., НИИ биологии Иркутского университета

Свет и байкальские рачки

Мы поговорим о некоторых новых исследованиях байкальской фауны, а именно эндемичных байкальских рачков-амфипод, которое проводится в НИИ биологии Иркутского университета. В этой лекции речь пойдет о том, как мы хотели открыть пигменты, придающие этим рачкам их необычный окрас, а в итоге обнаружили новое для науки семейство белков. Также вы узнаете о том, какие выводы об эволюции зрения рачков можно сделать по данным секвенирования и не только.

Присоединяйтесь: https://zoom.us/j/93949233368?pwd=ZXJQdURrLzcxSFM3clRHSDVDMWFGQT09

25 сентября (суббота), 14:00 — онлайн (ссылка будет опубликована здесь)

Оксана Станевич, врач-инфекционист ПСПбГМУ им. Павлова, соонователь ViriON, вирусологического лектория НИИ Гриппа

Феномен длительного вирусовыделения SARS-CoV-2: у кого, почему, и что дальше

Расскажу про то, у какой категории больных длительно может находиться в организме SARS-CoV-2, почему это происходит, к чему может привести, чем отличается от понятия «long covid» и можно ли справиться с этим при помощи вакцинации.

Биосеминары: снова с вами!

Это сообщение с трепетом, осторожностью и огромной радостью: Биосеминары выходят из спячки!

Весной 2020-го всё как-то неудачно совпало: отмены наших уже намеченных мероприятий, общая неопределённость и накопившаяся усталость (всё-таки проекту уже 10 лет!). В итоге Биосеминары, не проронив ни слова, заморозились :Р

Но уже тогда было ясно, что это не конец – просто нашей истории нужен был новый поворот. И вот он, этот поворот: на биофаке активно и с успехом заработало Студенческое научное общество (СНО). И именно под эгидой этих ребят Биосеминары откроют после перерыва очередной сезон этой осенью.

В этой связи у нас есть несколько предложений и просьб:

• порадоваться вместе с нами!
• проверить, что никуда не пропали ваши подписки на нас (https://bioseminars.wordpress.com/ и https://vk.com/bioseminars)
• напомнить / рассказать коллегам, студентам, однокурсникам, что Биосеминары есть
• поностальгировать и посмотреть записи прошедших Биосеминаров, коллекция огромна
• присылать нам идеи, кого позвать выступить (дистанционно или очно): сформировать программу после паузы не так просто, надеемся на поддержку!
• если вам интересно, следить за работой СНО, благодаря которому мы снова вместе – там много всего, помимо Биосеминаров: https://vk.com/sno_bio_spbu

Пусть академический год будет удачным и интересным, до встреч!

Запись лекции Константина Халтурина

Выкладываем запись лекции Константина Халтурина про жизненные циклы книдарий. Приятного просмотра!

Подробности о лекции: https://bioseminars.wordpress.com/2019/05/14/medusa-genomes/

Запись лекции Анны Краснодембской

Выкладываем долгожданную запись лекции Анны Краснодембской «Mезенхимные стволовые клетки для лечения поврежденных лёгких. Что они умеют делать?». Приятного просмотра!

Подробности о лекции: https://bioseminars.wordpress.com/2018/12/14/msc-pulmonology/

Запись лекции Кима Ласта (Kim Last)

Видео с лекции Кима Ласта «Zooplankton rhythms and clocks in a changing Arctic ocean». Приятного просмотра!

Подробности о лекции: https://bioseminars.wordpress.com/2019/02/28/zooplankton-rhythms-arctic/

Запись лекции Анны Марии Фиоре-Донно (Anna Maria Fiore-Donno)

С радостью выкладываем запись лекции Анны Марии Фиоре-Донно «Elusive soil protists — the last frontier of soil microbiome».

Подробности о лекции: https://bioseminars.wordpress.com/2019/02/09/soil-microbiome-cercozoa/
Не пропустите новые интересные лекции Биосеминаров! 😉

Integrating molecules and morphology: consensus or conflict in the symbiotic copepods?

Продолжаем Биосеминары в 2020! Ближайший будет на английском языке.

28 февраля, пятница,  17:30

140 (3058 ) аудитория

Integrating molecules and morphology: consensus or conflict in the symbiotic copepods?

Prof. Rony Huys

Natural History Museum, London

 

Научная карьера Рони началась в Университете Гента (Бельгия), а с 1992 года он работает в Natural History Museum в Лондоне. Его исследования посвящены вопросам систематики, филогении и экологической радиации копепод. Рони — автор книги “Copepod Evolution”  и бесчисленного количества публикаций по гарпактицидам и симбиотическим копеподам. Он постоянный организатор pre-conference workshops по эволюции и биоразнообразию копепод, которые проводятся каждые три года перед международным конгрессом по копеподам.

 

Копеподы – одна из самых многочисленных групп многоклеточных. По современных данным, происхождение группы связано с морским гипербентосом. Три основных пути радиации, пройденные копеподами неоднократно, – это переход в морской планктон, колонизация пресных вод и возникновение паразитизма. Учитывая довольно высокую специфичность и невероятный спектр потенциальных хозяев, симбиотические копеподы наверняка превосходят свободноживущих численно, демонстрируя при этом поразительное морфологическое разнообразие. Всё это породило некоторые противоречия в филогении и классификации копепод, но их можно разрешить с помощью молекулярных методов. В лекции мы рассмотрим примеры, когда молекулярные данные позволяют обнаружить ранее не замеченные морфологические признаки, которые могут быть использованы для реконструкции филогении копепод на уровне отрядов.

Будем благодарны за помощь в распространении информации (сделайте, пожалуйста, репосты Вконтакте; перешлите этот e-mail коллегам). Большое спасибо!

Чай и сладости не семинарах — благодаря вашим взносам на наш Яндекс.Кошелек.

Лекция состоится в Главном здании СПбГУ (Университетская наб., д. 7/9; вход с Менделеевской линии; 2 этаж). При входе необходимо предъявить паспорт или другой документ. Посещение свободное, предварительная запись не требуется.

Запись лекции Марины Пановой

С радостью выкладываем видео лекции Марины Пановой «Чем литторина отличается от колюшки: геном и геномика адаптивного расхождения морских улиток Littorina saxatilis».

Подробности о лекции: https://bioseminars.wordpress.com/2019/10/03/littorina-ecotypes/

Не пропустите новые интересные лекции Биосеминаров! 🙂