Начало

В декабре 2010 года появились Биосеминары.

Рубрика: Uncategorized | Оставить комментарий

Эволюционная биология развития: миникурс

Впервые за долгое время на Биосеминарах — миникурс; ещё помните, как это? 🙂 Автор — один из основателей Биосеминаров.  Обратите внимание, что начало в 17:00, и планируются «тройные» лекции с двумя перерывами. Этот миникурс проходит при поддержке Кафедры зоологии беспозвоночных СПбГУ.

16, 18 и 20 декабря,  17:00

140 (3058 ) аудитория

Эволюционная биология развития

Григорий Генихович, Dr. habil.

Group leader – Dept. of Molecular Evolution and Development,
University of Vienna

DSC_0066-crop

Григорий – выпускник биофака 2001 года (кафедра эмбриологии). Изучать развитие книдарий он начал ещё в Петербурге; с этими беспозвоночными связана и его дальнейшая работа за рубежом, в т.ч. диссертация (2004) и хабилитация (2016). После постдока в Норвегии начал работать в Университете Вены, сейчас руководит там научной группой и занимается вопросами эволюции планов строения животных, в частности проблемой эволюции молекулярных механизмов, отвечающих за становление осей тела.

Эволюционная биология развития – дисциплина старая и молодая
одновременно. Она появилась под именем «сравнительная эмбриология» в
середине XIX века, и обрела современный вид, когда обнаружилось, что не
только морфологические, но и молекулярные признаки могут использоваться,
чтобы понять, каким образом происходила эволюция планов строения
организмов. В предлагаемом мной коротком курсе мы коснемся следующих
вопросов:

16.12 (понедельник)
Лекция 1. Молекулярные механизмы возникновения различий.
•    Генетические механизмы дифференциации клеток
•    Причины возникновения различий
•    Проблема «безнадежных монстров»
•    Молекулярные основы регуляции транскрипции
•    Энхансеры и эволюционные изменения

18.12 (среда)
Лекция 2. Механизмы формирования паттерна.
•    Понятие позиционной информации
•    Механизмы интерпретации сигнального градиента и почему градиенты
обычно парные.
•    Механизм возникновения четких границ
•    Оси тела как система молекулярных координат
•    Роль физических факторов в формировании паттерна
•    Эволюция регуляции формирования осевого паттерна у животных

20.12 (пятница)
Лекция 3. Часть 1: Проблема гомологии и аналогии.
•    Определения гомологии и аналогии
•    Базовые принципы построения филогении и почему филогения – это
важно для биолога развития
•    Гомология / глубокая гомология / аналогия
•    Границы разрешения
Часть 2: Как сделать из немодельного объекта модельный.

Предыдущие выступления Григория на Биосеминарах есть в записи: доклад в 2010 году и миникурс в 2011.

Будем благодарны за помощь в распространении информации (сделайте, пожалуйста, репосты Вконтакте; перешлите этот e-mail коллегам; распечатайте и повесьте на работе объявления — цветные или чёрно-белые). Большое спасибо!

Чай и сладости не семинарах — благодаря вашим взносам на наш Яндекс.Кошелек.

Лекция состоится в Главном здании СПбГУ (Университетская наб., д. 7/9; вход с Менделеевской линии; 2 этаж). При входе необходимо предъявить паспорт или другой документ. Посещение свободное, предварительная запись не требуется.

Рубрика: Uncategorized | 1 комментарий

Запись лекции Григория Маркевича

С радостью выкладываем видео последнего Биосеминара про фауну Берингии. И хотим намекнуть: готовьтесь освободить время для крутых лекций 16-20 декабря. Подробности скоро 🙂

Объявление и дополнительную информацию о лекции можно посмотреть здесь.

Качество аудио во второй половине, к сожалению, хуже чем в начале — приносим свои извинения.
Видео | Posted on by | Оставить комментарий

Фауна Берингии

Приглашаем на Биосеминар – уже совсем скоро!

24 октября, четверг,  17:30

140 (3058 ) аудитория

Неизвестная фауна озер Берингийской области – новейшие зоогеографические открытия

Григорий Маркевич, к.б.н.

с.н.с. Кроноцкого государственного заповедника

IMG_9240Григорий закончил кафедру ихтиологии биологического факультета МГУ им. М.В. Ломоносова в 2005 году. В 2008 году, там же защитил кандидатскую диссертацию по теме «Интродукция жилой формы нерки Oncorhynchus nerka (Walb.) в безрыбные водоемы Камчатки». В дальнейшем: (1) принимал участие в изучении структуры ихтиофауны эстуария реки Камчатки; (2) руководил проектом по изучению эволюционных механизмов формирования фауны рыб озера Кроноцкое; (3) принимал участие в проекте по изучению реликтовой фауны гольцов Камчатки; (4) принимал участие в проекте по изучению путей формирования мозаики формирования рыб Берингии.

Берингия – регион нашей страны, включающий Чукотку, Корякию и северную Камчатку. Разнообразие рыб этой биогеографической области сформировалось на фоне многократных оледенений, в ходе которых происходили фрагментации ареалов и образование новых групп, а в межледниковые эпохи – встречное расселение групп. Реконструкция структуры этого разнообразия, путей и этапов его формирования поможет определить механизмы эволюции животного мира в экстремальных условиях Арктики и уточнить историю протекания ледниковых эпох.

Многие ключевые водные объекты региона до последнего времени оставались «белым пятном» для ученых. В 2019 году под эгидой Кроноцкого государственного заповедника при поддержке Фонда президентских грантов была проведено масштабное исследование десятков озер Корякии и Чукотки. Мы получили принципиально новые данные о структуре фауны рыб территории, нашли более десятка новых эндемичных и реликтовых форм, населяющих озера всего региона.

В лекции Григорий поделится результатами этих исследований, покажет фотографии из экспедиции и расскажет о современной технике проведения работ в условиях Крайнего Севера.

маршрут_экспедиции

Маршрут экспедиции

 

Будем благодарны за помощь в распространении информации (сделайте, пожалуйста, репосты Вконтакте; перешлите этот e-mail коллегам; распечатайте и повесьте на работе объявления — цветные или чёрно-белые). Большое спасибо!

Чай и сладости не семинарах — благодаря вашим взносам на наш Яндекс.Кошелек.

Лекция состоится в Главном здании СПбГУ (Университетская наб., д. 7/9; вход с Менделеевской линии; 2 этаж). При входе необходимо предъявить паспорт или другой документ. Посещение свободное, предварительная запись не требуется.

Рубрика: Uncategorized | 1 комментарий

Чем литторина отличается от колюшки

Рады объявить, что Биосеминары продолжаются, и первый доклад в этом академическом году — от выпускницы биофака, которая сейчас работает в Швеции.

10 октября, четверг,  17:30

140 (3058 ) аудитория

Чем литторина отличается от колюшки: геном и геномика адаптивного расхождения морских улиток Littorina saxatilis

Марина Панова, PhD, доцент

Researcher, Director of Studies at the Department of Marine Sciences, University of Gothenburg, Sweden

 

Марина Панова – выпускница кафедры зоологии беспозвоночных 1998 года. Она занималась экологией литоральных моллюсков Littorina saxatilis под руководством А.И. Грановича. В 2007 в Гетеборгском Университете она защитила диссертацию, посвященную популяционной генетике L. saxatilis, и с с тех пор продолжает там работу по геномике морских организмов в Институте Морских Наук. Литоральные моллюски рода Littorina остаются основным объектом изучения Марины, включая проект по de novo секвенированию генома L. saxatilis. На семинаре она расскажет об этом геномном проекте и изменениях генома улиток в процессе их адаптации к различной среде обитания.

Приспособление к местным условиям обитания и морфологически различающиеся экотипы – идеальная система для изучения «эволюции в действии», особенно если они повторяются в природе. А современные геномные технологии теперь дают нам возможность в деталях изучить генетическую основу адаптаций. Ставший уже классическим пример – трёхиглая колюшка с её пресноводным и морским экотипами. Литоральные улитки Littorina saxatilis в плане морфологической вариации не отстают от колюшки: у них есть сильно различающиеся «крабовый» и «прибойный» экотипы, живущие на североатлантическом побережье Швеции, Великобритании и Испании.

На докладе Марина расскажет о восьмилетнем проекте по секвенированию генома литторины и выявлению генетических различий между её экотипами, а также о том, чем работа с геномом моллюска отличается от работы с геномом рыб, и какие сюрпризы улитки приготовили для эволюционных биологов.

Будем благодарны за помощь в распространении информации (сделайте, пожалуйста, репосты Вконтакте; перешлите этот e-mail коллегам; распечатайте и повесьте на работе объявления — цветные или чёрно-белые). Большое спасибо!

Чай и сладости не семинарах — благодаря вашим взносам на наш Яндекс.Кошелек.

Лекция состоится в Главном здании СПбГУ (Университетская наб., д. 7/9; вход с Менделеевской линии; 2 этаж). При входе необходимо предъявить паспорт или другой документ. Посещение свободное, предварительная запись не требуется.

Рубрика: Uncategorized | Оставить комментарий

Что такое медузы и откуда они взялись?

Каникулы откладываются — биосеминар через неделю 🙂 Мы рады возможности послушать из первых рук историю, которая только-только вышла в Nature Ecology and Evolution — а вы? Напоминаем, что наши чай и сладости зависят от вашей финансовой поддержки.

21 мая, вторник,  17:30

140 (3058 ) аудитория

Что такое медузы и откуда они взялись?

Константин Халтурин, Dr. rer. nat. habil.

Okinawa Institute of Science and Technology Graduate University, Marine Genomics Unit, Japan

Константин — выпускник кафедры зоологии беспозвоночных СПбГУ. В 2002 он защитил диссерацию в Киле (Zoological Institute of Christian-Albrechts  University), остался там работать и прошёл хабилитацию. Работал в Швеции, Израиле, Норвегии, США; с 2017 года — в Японии. На Биосеминаре Константин расскажет о своей работе, недавно опуликованной в Nature Ecology & Evolution.

 

Впечатляющие по сложности жизненные циклы характерны для одной из самых древних групп многоклеточных животных — книдарий. Они могут включать в себя чередование двух различных онтогенезов и трёх жизненных форм: планул, полипов и медуз. Особи разных поколений совершенно не похожи друг на друга, но формирются на основе единого генома — за счёт дифференциальной регуляции его работы.

Жизненные циклы книдарий могут быть разнообразны по структуре. У кораллов и актиний (Anthozoa) есть только стадия полипа, а у Hydrozoa, Cubozoa и Scyphozoa — и полипы, и медузы. Как же различаются генетические программы у животных, способных к образованию медузоидной стадии и тех, у которых эта стадия отсутствует?

В рамках доклада будут рассмотрены три основных вопроса:

(1) Как контролируется переход от одной стадии жизненного цикла к другой?

(2) Что такое медуза с точки зрения генетики и молекулярной биологии?

(3) Какая стадия появилась первой — полип или медуза?

Будем благодарны за помощь в распространении информации (сделайте, пожалуйста, репосты Вконтакте; перешлите этот e-mail коллегам; распечатайте и повесьте на работе объявления — цветные или чёрно-белые). Большое спасибо!

Лекция состоится в Главном здании СПбГУ (Университетская наб., д. 7/9; вход с Менделеевской линии; 2 этаж). При входе необходимо предъявить паспорт или другой документ. Посещение свободное, предварительная запись не требуется.

Рубрика: Uncategorized | Оставить комментарий

Linking patterns and processes of species diversification in insects: from phylogeny to population genomics

Через неделю приглашаем вас на заключительный биосеминар в этом сезоне! Напоминаем, что вход на все наши лекции свободный, предварительная запись не требуется. Если вам нравятся биосеминары и наши чайные паузы, вы можете поддержать проект: Яндекс.Деньги

25 апреля, четверг,  17:30

140 (3058 ) аудитория

Linking patterns and processes of species diversification in insects: from phylogeny to population genomics

Dr. Laurence Després, 

 Professor, Université Grenoble Alpes

 

Laurence Després защитила диссертацию в Университете Монпелье. Сейчас она профессор, преподает эволюционную экологию и филогенетику в Университете Гренобля , а также руководит магистерской программой «Биоразнообразие, экология и эволюция». Основные научные интересы — эволюционная экология взаимодействия видов и коэволюция. Большинство проектов, которые ведет Лоуренс, сочетают методы популяционной генетики и филогенетического анализа, а также экологические, биохимические и поведенческие исследования. Конечная их цель — проверка гипотез об эволюционных процессах или об адаптации ко многим факторам.

Видообразование при сохранении потока генов встречается чаще, чем мы привыкли считать. Однако как при этом осуществляется фенотипическая дивергенция и возникает репродуктивнаяизоляция остается малопонятным. Кроме того, нет единого мнения о роли гибридизации в увеличении числа видов и в адаптивной радиации.

На биосеминаре мы сперва поговорим о филогенетических закономерностях и экологических процессах, которые стоят за видовой диверсификацией в двух системах «растение — насекомое-фитофаг, питающееся их семенами». Это альпийские мухи, связанные с купальницей и лиственницей. Видообразование у этих насекомых запускается фенологическими сдвигами у растения-хозяина. Такой способ симпатрического видообразования гораздо менее изучен, чем хорошо известный для насекомых-фитофагов вариант видообразования за счёт смены растения-хозяина.

Во второй части семинара речь пойдет о роли гибридизации в диверсификации бабочек Coenonympha с учётом высотного градиента в Альпах (4 линии) и о дифференциальных паттернах геномной интрогрессии в зоне контакта. Геном гибридной линии  (C. macromma) на 70% соответствует геному C. arcania и на 30% —геному C. gardetta. Однако интересно, что степень интрогрессии при этом намного выше между C. macromma и C. gardetta (два альпийских вида), чем между C. macromma и C. arcania (альпийский и долинный виды, соответственно). Это наводит на мысль о ключевой роли экологии в репродуктивной изоляции.

 

 

Будем благодарны за помощь в распространении информации (сделайте, пожалуйста, репосты Вконтакте; перешлите этот e-mail коллегам; распечатайте и повесьте на работе объявления — цветные и чёрно-белые). Большое спасибо!

Лекция состоится в Главном здании СПбГУ (Университетская наб., д. 7/9; вход с Менделеевской линии; 3 этаж). При входе в университет необходимо предъявить паспорт или другой документ. Посещение биосеминаров свободное, предварительная запись не требуется. Все лекции записываются на видео, но их публикация пока отстает во времени 😦

Рубрика: Uncategorized | 1 комментарий

Помутнение рассудка: фазовые переходы прионного белка в болезни Альцгеймера

А вы помните, что исходно Биосеминары — это семинары выпускников? Хороший повод вспомнить:

11 апреля, четверг,  17:30

140 (3058 ) аудитория

Помутнение рассудка: фазовые переходы прионного белка в болезни Альцгеймера

Михаил Костылев, PhD

Yale University, USA

 

Миша закончил биофак СПбГУ в 2009 году, защитил PhD в Йельском университете в 2016 году, а потом продолжил работу там же в лаборатории Стивена Стриттматтера (Stephen Strittmatter). В 2018 году он также стал сооснователем компании Proteowise, занимающейся разработкой технологии доступной и быстрой мультиплексной детекции белков в широком спектре биологических образцов.

 

 

 

Болезнь Альцгеймера (БА) — неизлечимое нейродегенеративное заболевание со 100% смертностью. Это самая распространённая форма деменции с десятками миллионов зарегистрированных случаев (новый диагноз ставится примерно каждые 7 секунд). Накопление аггрегированного бета-амилоида (Aβ) во внеклеточном пространстве является отличительной чертой заболевания. С ним также ассоциированы мутации в генах, которые кодируют белки, ответственные за метаболизм Aβ. Эти данные привели к формулировке амилоидной гипотезы БА. Интересно то, что нейродегенератиые эффекты Aβ не пассивные, а требуют наличия рецептора к нему на поверхности нейронов. Такой рецептор был обнаружен в нашей лаборатории результате высокопроизводительного скрининга всего генома (2009) — и, к удивлению, им оказался клеточный прионный белок (PrPc).

PrPc известен, прежде всего, как немикробный инфекционный агент, вызывающий прионные заболевания млекопитающих. В своей работе я обнаружил, что связывание Aβ с клеточным прионным белком на поверхности клеток вызывает самосборку PrPc и нейротоксичного олигомерного Aβ в гелеобразный материал. При этом происходят масштабные конформационные изменения в PrPc и активируется клеточный сигналинг. Явления специфичной самосборки белков в немембранные органеллы, такие как жидкостные капли (например, ядрышко) или гели, стали “горячей” темой в клеточной биологии и являются важным механизмом регуляции клеточной физиологии. Такую самосборку белков в обособленные компартменты часто называют “фазовым разделением” или “биомолекулярной конденсацией”. Интересно, что нарушения в фазовом разделении часто ведут к нейродегенерации. В настоящий момент конденсация PrPc и Aβ является первым случаем такой самосборки на поверхности клетки и может являться важной частью патофизиологии БА, а также иметь более широкое значение, в том числе и для биологии “классических” прионных заболеваний.

Будем благодарны за помощь в распространении информации (сделайте, пожалуйста, репосты Вконтакте; перешлите этот e-mail коллегам; распечатайте и повесьте на работе объявления — цветные или чёрно-белые). Большое спасибо!

Лекция состоится в Главном здании СПбГУ (Университетская наб., д. 7/9; вход с Менделеевской линии; 2 этаж). При входе необходимо предъявить паспорт или другой документ.

Рубрика: Uncategorized | 1 комментарий