Начало

В декабре 2010 года появились Биосеминары.

Реклама
Рубрика: Uncategorized | Оставить комментарий

Linking patterns and processes of species diversification in insects: from phylogeny to population genomics

Через неделю приглашаем вас на заключительный биосеминар в этом сезоне! Напоминаем, что вход на все наши лекции свободный, предварительная запись не требуется. Если вам нравятся биосеминары и наши чайные паузы, вы можете поддержать проект: Яндекс.Деньги

25 апреля, четверг,  17:30

140 (3058 ) аудитория

Linking patterns and processes of species diversification in insects: from phylogeny to population genomics

Dr. Laurence Després, 

 Professor, Université Grenoble Alpes

 

Laurence Després защитила диссертацию в Университете Монпелье. Сейчас она профессор, преподает эволюционную экологию и филогенетику в Университете Гренобля , а также руководит магистерской программой «Биоразнообразие, экология и эволюция». Основные научные интересы — эволюционная экология взаимодействия видов и коэволюция. Большинство проектов, которые ведет Лоуренс, сочетают методы популяционной генетики и филогенетического анализа, а также экологические, биохимические и поведенческие исследования. Конечная их цель — проверка гипотез об эволюционных процессах или об адаптации ко многим факторам.

Видообразование при сохранении потока генов встречается чаще, чем мы привыкли считать. Однако как при этом осуществляется фенотипическая дивергенция и возникает репродуктивнаяизоляция остается малопонятным. Кроме того, нет единого мнения о роли гибридизации в увеличении числа видов и в адаптивной радиации.

На биосеминаре мы сперва поговорим о филогенетических закономерностях и экологических процессах, которые стоят за видовой диверсификацией в двух системах «растение — насекомое-фитофаг, питающееся их семенами». Это альпийские мухи, связанные с купальницей и лиственницей. Видообразование у этих насекомых запускается фенологическими сдвигами у растения-хозяина. Такой способ симпатрического видообразования гораздо менее изучен, чем хорошо известный для насекомых-фитофагов вариант видообразования за счёт смены растения-хозяина.

Во второй части семинара речь пойдет о роли гибридизации в диверсификации бабочек Coenonympha с учётом высотного градиента в Альпах (4 линии) и о дифференциальных паттернах геномной интрогрессии в зоне контакта. Геном гибридной линии  (C. macromma) на 70% соответствует геному C. arcania и на 30% —геному C. gardetta. Однако интересно, что степень интрогрессии при этом намного выше между C. macromma и C. gardetta (два альпийских вида), чем между C. macromma и C. arcania (альпийский и долинный виды, соответственно). Это наводит на мысль о ключевой роли экологии в репродуктивной изоляции.

 

 

Будем благодарны за помощь в распространении информации (сделайте, пожалуйста, репосты Вконтакте; перешлите этот e-mail коллегам; распечатайте и повесьте на работе объявления — цветные и чёрно-белые). Большое спасибо!

Лекция состоится в Главном здании СПбГУ (Университетская наб., д. 7/9; вход с Менделеевской линии; 3 этаж). При входе в университет необходимо предъявить паспорт или другой документ. Посещение биосеминаров свободное, предварительная запись не требуется. Все лекции записываются на видео, но их публикация пока отстает во времени 😦

Рубрика: Uncategorized | 1 комментарий

Помутнение рассудка: фазовые переходы прионного белка в болезни Альцгеймера

А вы помните, что исходно Биосеминары — это семинары выпускников? Хороший повод вспомнить:

11 апреля, четверг,  17:30

140 (3058 ) аудитория

Помутнение рассудка: фазовые переходы прионного белка в болезни Альцгеймера

Михаил Костылев, PhD

Yale University, USA

 

Миша закончил биофак СПбГУ в 2009 году, защитил PhD в Йельском университете в 2016 году, а потом продолжил работу там же в лаборатории Стивена Стриттматтера (Stephen Strittmatter). В 2018 году он также стал сооснователем компании Proteowise, занимающейся разработкой технологии доступной и быстрой мультиплексной детекции белков в широком спектре биологических образцов.

 

 

 

Болезнь Альцгеймера (БА) — неизлечимое нейродегенеративное заболевание со 100% смертностью. Это самая распространённая форма деменции с десятками миллионов зарегистрированных случаев (новый диагноз ставится примерно каждые 7 секунд). Накопление аггрегированного бета-амилоида (Aβ) во внеклеточном пространстве является отличительной чертой заболевания. С ним также ассоциированы мутации в генах, которые кодируют белки, ответственные за метаболизм Aβ. Эти данные привели к формулировке амилоидной гипотезы БА. Интересно то, что нейродегенератиые эффекты Aβ не пассивные, а требуют наличия рецептора к нему на поверхности нейронов. Такой рецептор был обнаружен в нашей лаборатории результате высокопроизводительного скрининга всего генома (2009) — и, к удивлению, им оказался клеточный прионный белок (PrPc).

PrPc известен, прежде всего, как немикробный инфекционный агент, вызывающий прионные заболевания млекопитающих. В своей работе я обнаружил, что связывание Aβ с клеточным прионным белком на поверхности клеток вызывает самосборку PrPc и нейротоксичного олигомерного Aβ в гелеобразный материал. При этом происходят масштабные конформационные изменения в PrPc и активируется клеточный сигналинг. Явления специфичной самосборки белков в немембранные органеллы, такие как жидкостные капли (например, ядрышко) или гели, стали “горячей” темой в клеточной биологии и являются важным механизмом регуляции клеточной физиологии. Такую самосборку белков в обособленные компартменты часто называют “фазовым разделением” или “биомолекулярной конденсацией”. Интересно, что нарушения в фазовом разделении часто ведут к нейродегенерации. В настоящий момент конденсация PrPc и Aβ является первым случаем такой самосборки на поверхности клетки и может являться важной частью патофизиологии БА, а также иметь более широкое значение, в том числе и для биологии “классических” прионных заболеваний.

Будем благодарны за помощь в распространении информации (сделайте, пожалуйста, репосты Вконтакте; перешлите этот e-mail коллегам; распечатайте и повесьте на работе объявления — цветные или чёрно-белые). Большое спасибо!

Лекция состоится в Главном здании СПбГУ (Университетская наб., д. 7/9; вход с Менделеевской линии; 2 этаж). При входе необходимо предъявить паспорт или другой документ.

Рубрика: Uncategorized | 1 комментарий

Modelling to support development and regulation of aquaculture in Scotland, UK

В ближайший вторник продолжаем мини-серию докладов британских учёных (точне — морских биологов из Шотландии!)

Этот Биосеминар также организован при поддержке Научно-инновационной сети Великобритании в России (UK Science and Innovation Network in Russia)

Напоминаем, что кофе-брейки можно поддержать переводом на наш Яндекс-кошелек

[ Не можем не обратить ваше внимание на лекцию одного из мировых лидеров в области эволюционной биологии развития Andreas Hejnol 18 марта — подробности на странице Биологического факультета СПбГУ) ]

19 марта, вторник,  17:30

140 (3058 ) аудитория

Modelling to support development and regulation of aquaculture in Scotland, UK

Dr Thomas Adams

The Scottish Association for Marine Science

 

«Мне интересна экологическая динамика популяций и её зависимость от внешних факторов естественной или антропогенной природы. Я работаю над использованием математических и вычислительных подходов для понимания, как основные движущие силы на уровне особи (размножение, расселение, рост и смертность) определяют структуру популяции и её динамику в пространстве и времени. Мне также интересны вопросы менеджмента, которые возникают в связи с использованием природных ресурсов для целей человека. Большая часть моей работы посвящена исследованию морских личинок в приложении к популяционной динамике прибрежных организмов в Великобритании, в том числе паразитических ракообразных, которые влияют на разведение лососевых рыб, и разных бентосных организмов (местных и видов-вселенцев)».

The Scottish aquaculture industry is a key component of the national economy. While it is primarily based on farming of Atlantic salmon, many other species are also farmed, including other fish species, shellfish, and seaweeds. The Scottish government seeks to achieve sustainable development of the aquaculture industry over the coming decade. However, there is limited space available for the expansion of the industry, in addition to increasing public awareness and concern regarding environmental issues.

In order to tackle these challenges, and to ensure that a balance between the interests of industry, government and public is reached, there has been an increasing use of computer modelling approaches. These models include deposition of marine farm waste products, understanding suitability of hydrodynamic conditions, and the challenges associated with sea lice and harmful algal blooms. At present, there is a drive towards increased integration and robustness of analytical approaches, and with this in mind I will give an overview of modelling for aquaculture in Scotland; summarising historical developments, present capability, and likely future developments.

Будем благодарны за помощь в распространении информации (сделайте, пожалуйста, репосты Вконтакте; перешлите этот e-mail коллегам; распечатайте и повесьте на работе объявления — цветные и чёрно-белые). Большое спасибо!

Лекция состоится в Главном здании СПбГУ (Университетская наб., д. 7/9; вход с Менделеевской линии; 2 этаж). При входе необходимо предъявить паспорт или другой документ.

Рубрика: Uncategorized | Оставить комментарий

Zooplankton rhythms and clocks in a changing Arctic ocean

🌺 Продолжаем удивительную весеннюю программу 🌺

Биосеминар организован при поддержке Научно-инновационной сети Великобритании в России (UK Science and Innovation Network in Russia)

7 марта, четверг,  17:30

140 (3058 ) аудитория

Zooplankton rhythms and clocks in a changing Arctic ocean

Dr. Kim Last, 

The Scottish Association for Marine Science

«Мне интересно, как деятельность человека влияет на морские организмы на разных уровнях – поведенческом, физиологическом и генетическом. По мере того, как люди меняют облик планеты, животные вынуждены приспосабливаться – или они вымирают; я надеюсь, что могу хотя бы как-то помочь избегать последнего. Я очарован тем, как животные способны определять время. Это привело меня к изучению хронобиологии полихет в илистых эстуариях и зоопланктона в Арктике. Я с удивлением обнаружил, что эти организмы с удивительной ловкостью оказываются в нужном месте в нужное время! Думаю, что я занимаюсь «прикладной» наукой, и мне очень нравится отвечать на сложные вопросы, создавая новые технологии – зачастую в очень недружелюбных краях – и налаживая связь между биологией и физикой окружающей среды.

Я изучал биологию в Университете Портсмута,  потом закончил магистратуру в области рыбного хозяйства в Бангорском Университете. Пару лет я работал наблюдателем на рыболовецких судах в северо-западной Атлантике, а потом поступил в аспирантуру к профессору Питеру Оливу в Университете Ньюкастла. Моя диссертация была посвящена фотопериодизму у полихет, то есть тому, как они оценивают длину дня; в ней был и коммерческий аспект, связанный с марикультурой полихет. В итоге это привело меня к исследовательской позиции в Scottish Association for Marine Sciences (SAMS), где я с тех пор и работаю».

Biological clocks are central to all living systems. They provide a measure of time so that organisms can anticipate and adapt to cyclic changes in their environment.  Whilst the genetic basis of this clock is well established in terrestrial species it has remained, until recently, elusive in marine organisms. New findings by our group suggest that in marine copepods and krill at least, clock genes underpin daily and seasonal behavioural/physiological rhythms.

Even in extreme high latitude marine environments, without measurable solar illumination in winter, light-mediated biological activity is evident that is driven by moon- rather than, sunlight. However with climate change, which is at its most extreme in the Arctic, copepods and krill are extending their habitat ranges polewards tracking isotherms into different light environments, potentially altering clock function and phenology. Behavioural, physiological and genetic data collected from around the Arctic and North Atlantic, has revealed unexpected variability in the behaviour of individual animals suggesting adaptation potential. Ultimately, understanding copepod and krill responses to climate change is required in order to predict future changes in ecosystem function and biogeochemical cycling.

Будем благодарны за помощь в распространении информации (сделайте, пожалуйста, репосты Вконтакте; перешлите этот e-mail коллегам; распечатайте и повесьте на работе объявления — цветные и чёрно-белые). Большое спасибо!

Лекция состоится в Главном здании СПбГУ (Университетская наб., д. 7/9; вход с Менделеевской линии; 2 этаж). При входе необходимо предъявить паспорт или другой документ.

Рубрика: Uncategorized | Оставить комментарий

Elusive soil protists — the last frontier of soil microbiome

Ближайшие биосеминары будут на английском, вот анонс первого из них — приходите послушать про почвенных протистов! Хотим также напомнить, что чайно-кофейные потребности Биосеминаров покрываются благодаря вашим переводам на наш Яндекс-кошелёк.

15 февраля, пятница,  17:30

140 (3058 ) аудитория

Elusive soil protists — the last frontier of soil microbiome. Example of Cercozoa (Rhizaria) worldwide diversity

Dr. Anna Maria Fiore-Donno, 

University of Cologne, Zoology Institute, Terrestrial Ecology Group

 

Анна Мария Фиоре-Донно получила степень PhD в области микологии, работала в Великобритании, Швейцарии и Японии. Её исследовательские проекты были связаны с изучением одноклеточныз эукариот (протистов) относящихся к супергруппе Amoebozoa. Сейчас Анна Мария  занимается протистами, обитающими в почве, используя методы метагеномики и метатранскриптомики, а также общими вопросами эволюции эукариот.

Cercozoa, according to both observations under the microscope and molecular environmental sampling, is one of the major protistan groups in the soil. We use Cercozoa as a model to unveil local and global patterns driving the protistan distribution in soils. This huge phylum comprises a vast array of morphologies (naked and testate amoebae as well as flagellates) and nutrition modes (bacterivores, algivores, fungivores, autotrophs, mixotrophs and parasites). We study this variety to disentangle cercozoan role in the soil food-web and how they are differentially influenced by biotic and abiotic edaphic factors. We developed specific primers targeting the group and also classified the Cercozoa according to functional traits in morphology, nutrition modes and locomotion. I will summarize and discuss our latest findings on cercozoan worldwide distribution, as revealed by high-throughput sequencing, in varied environments such as drylands, temperate grasslands and forests, biological crusts and agricultural soils.

Будем благодарны за помощь в распространении информации (сделайте, пожалуйста, репосты Вконтакте; перешлите этот e-mail коллегам; распечатайте и повесьте на работе объявления). Большое спасибо!

Лекция состоится в Главном здании СПбГУ (Университетская наб., д. 7/9; вход с Менделеевской линии; 2 этаж). При входе необходимо предъявить паспорт или другой документ.

Рубрика: Uncategorized | Оставить комментарий

Mезенхимные стволовые клетки для лечения  поврежденных лёгких. Что они умеют делать?

Биосеминарам исполняется 8 лет, и мы вас приглашаем на замечательную лекцию! А ещё благодарим всех наших слушателей и докладчиков — именно вы создаёте Биосеминары, а мы только немного помогаем 🙂 Счастливого Нового года!

25 декабря, вторник,  17:30

140 (3058 ) аудитория

Mезенхимные стволовые клетки для лечения  поврежденных лёгких. Что они умеют делать?

Анна Краснодембская, к.б.н., Lecturer (Group Leader),

Centre for Experimental Medicine, Queen’s University of Belfast, UK

Анна Краснодембская защитила кандидатскую диссертацию в СПбГУ в 2005 году, потом преподавала здесь на кафедре Цитологии и гистологии и одновременно занималась научными исследованиями в Институте экспериментальной медицины. В 2009-2013 Анна  была постдоком в University of California San Francisco в лаборатории профессора Michael Matthay, крупнейшего мирового специалиста в области пульмонологии. С 2013 года получила должность руководителя научной группы в Queen’s University of Belfast. Исследования, которые проводятся в группе, финансируются UK Medical Research Council и Wellcome Trust. Публикации Анны Краснодембской (в т.ч. в ключевых тематических журналах журналах Stem Cells, American Journal of Respiratory and Critical Care Medicine, Thorax и др.) цитируются в общей сложности более 1200 раз. В 2017 году Анна стала лауреатом премии STEM CELL’s Young Investigator Award, которая присуждается молодым учёным – авторам статей, оказавших особенное влияние в мире.

Острый респираторный дистресс-синдром (ОРДС) – это спектр тяжелых острых проявлений дыхательной недостаточности, которые являются важнейшей причиной осложнений и смерти у пациентов в критическом состоянии; при этом специализированной терапии не существует. У мезенхимных стволовых клеток (МСК) есть великолепный терапевтический потенциал для многих болезней за счёт их уже хорошо известных иммуномодулирующих и регенерационных свойств. Их использование в клинике для лечения ОРДС активно разрабатывается, однако чтобы оно было эффективным, необходимо лучше понимать механизмы работы МСК. Как МСК изменяют репаративные возможности клеток, вовлеченных в патофизиологию ОРДС? Оказывается, они не только обладают высокой способностью к секреции многочисленных биологически активных паракринных медиаторов (цитокинов и факторов роста), но и активно взаимодействуют с другими клетками за счет транспортировки своего цитоплазматического содержимого с помощью нано-трубочек и выделения внеклеточных везикул. В докладе речь пойдёт о том, как МСК модулируют макрофаги и лёгочные эпителиальные клетки, транспортируя функционально активные митохондрии; а также о роли регуляторных miRNA, переносимых во внеклеточных везикулах МСК. Доклад будет построен на новых результатах, полученных в группе Анны Краснодембской.

Будем благодарны за помощь в распространении информации (сделайте, пожалуйста, репосты Вконтакте; перешлите этот e-mail коллегам; распечатайте и повесьте на работе объявления — цветные или чёрно-белые). Большое спасибо!

Лекция состоится в Главном здании СПбГУ (Университетская наб., д. 7/9; вход с Менделеевской линии; 2 этаж). При входе необходимо предъявить паспорт или другой документ.

Рубрика: Uncategorized | Оставить комментарий

От кузена Бенедикта к кибертаксономии

Приглашаем Вас на очередной биосеминар!

14 ноября (среда),  17:30

аудитория 3058 (140)

От кузена Бенедикта к кибертаксономии: судьба зоологической систематики за последние 100 лет

Максим Винарский, д.б.н.,

зав. Лабораторией макроэкологии и биогеографии беспозвоночных СПбГУ

Максим Винарский с 2003 по 2015 г. работал в должностях старшего преподавателя, доцента, профессора и старшего научного сотрудника в разных вузах г. Омска, с января 2016 г. работает в Санкт-Петербургском государственном университете. Основные научные интересы М. Винарского сосредоточены в области систематики, филогенетики и биогеографии пресноводных моллюсков, что не мешает ему делать периодические экскурсы в области паразитологии, истории зоологии и теоретических основ биологической систематики. Текущие научные занятия докладчика связаны с глобальной таксономической ревизией семейства Lymnaeidae (прудовиковые), исследованием разнообразия водных моллюсков Понто-Каспийского региона, а также изучением истории теоретической систематики в России в первой половине ХХ столетия.

Доклад будет посвящен истории развития зоологической систематики в 20 веке и её современному состоянию. К обсуждению предлагаются следующие темы:

Почему стали модны разговоры о «кризисе» систематики как науки и как мы дошли до жизни такой? Классификация организмов – это точная наука или «собирание марок» (по Резерфорду)? Как систематики обучались статистике и что из этого вышло. Сельди северной Атлантики = «галапагосские вьюрки» систематиков. К чему привела «молекулярная революция» в систематике и не грозит ли это отмиранием данной отрасли биологии? Биологический вид как математическая абстракция. Как выжить систематику в мире наукометрии, рейтингов и «хиршебесия»? О «турботаксономии», «кибертаксономии» и прочих нехороших словах. Is Linnaeus really dead?

Будем благодарны за помощь в распространении информации (сделайте, пожалуйста, репосты Вконтакте; перешлите этот e-mail коллегам; распечатайте и повесьте на работе объявления — цветные или чёрно-белые). Большое спасибо!

Лекция состоится в Главном здании СПбГУ (Университетская наб., д. 7/9; вход с Менделеевской линии; 2 этаж). При входе необходимо предъявить паспорт или другой документ.

Рубрика: Uncategorized | Оставить комментарий